El Prorrectorado de investigación se vincula con los servicios y facultades de la Universidad a través de los Ayudantes del Prorrectorado.

Esta figura ese creó con el objetivo de dinamizar el vínculo entre este espacio institucional, los servicios y centros universitarios regionales de la Universidad de la República en materia de investigación y formación de posgrado.

Las actividades de los ayudantes se concentran en:

• Apoyar la difusión y la comunicación de aspectos relacionados con los programas de apoyo a investigación y posgrado que gestionan las diversas comisiones que integran el Prorrectorado.
• Apoyar la articulación de la actividad del Prorrectorado con las actividades que se realizan en los servicios universitarios en materias de investigación y posgrado.
• Relevar y sistematizar información sobre las actividades de investigación y formación de posgrado en los servicios y centros universitarios regionales.
• Apoyar la realización de eventos del Prorrectorado.